Бактерии наряду с археями были одними из первых живых организмов на Земле, появившись около 3,9—3,5 млрд лет назад.
В отличие от вредных (патогенных) бактерий существуют полезные бактерии для человека. Полезные бактерии для человек повышают иммунитет, вырабатывают витамины и улучшают состав крови. Полезные бактерии для человека оказывают неоценимую заслугу при производстве кваса и пива, уксуса и вина, выпечке хлебо-булочных изделий. Молочная промышленность вообще бы не существовала, если бы не полезные бактерии. Для человека очень полезны кефир, простокваша, сметана, йогурт и другие молочные продукты. Полезные бактерии для человека сохраняют такие важные продукты как: лук, чеснок, мед, яйцо. Кулинары используют лимонную кислоту, добытую из плесневых грибков
(которые тоже относятся к микромиру), агрономы — бактериальные препараты
для борьбы с болезнями и вредителями культурных растений, зоотехники
готовят питательные и долго хранящиеся корма для сельскохозяйственных
животных (такие как силос), фармацевты — разнообразные антибиотики,
вакцины, ферменты, витамины.
В кишечнике человека находится целая фабрика полезных бактерий, где они трудятся, производя витамины, перерабатывая пищу и вырабатывая для этого ферменты.
Понятие "нормальная микрофлора человека" содержит в себе целый комплекс полезных микроорганизмов. Ацидофильные и бифидобактерии, а также кишечная палочка обладают
антибиотическими (т. е. подавляющими жизнедеятельность) свойствами по
отношению к гнилостным и патогенным микробам.
Природой так заложено, что в окружающей человека среде одновременно существуют и борятся между собой вредные и полезные бактерии для человека. Устойчивый иммунитет здорового человека подразумевает постоянные победы полезных для человека бактерий над вредными.
В последние десятилетия человек научился использовать ряд патогенных бактерий для своей пользы, например при производстве гербицидов, выделяющие токсины от насекомых. Бактерии применяются в биохимии, генной инженерии, генетике, молекулярной биологии и т.д. Человек с помощью бактерий научился очищать почвы и водоемы от нефтепродуктов.
